RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 OPLAHO14841 1288 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 DAPK3O43293 454 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 POTEIP0CG38 1075 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 EZRP15311 586 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PLCG2P16885 1265 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF543Q08ER8 600 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 POTEGQ6S5H5 508 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 POTEEQ6S8J3 1075 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 TMC3Q7Z5M5 1100 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 METTL13Q8N6R0 699 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 MASTLQ96GX5 879 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L15C9J2P7 530 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L13C9JLJ4 530 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L11C9JVI0 530 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L18D6R9N7 530 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L22D6RA61 530 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L17D6RBQ6 530 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L19D6RCP7 530 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L20D6RJB6 530 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGA4P13612 1032 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ALDH1B1P30837 517 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L24Q0WX57 530 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 C10orf76Q5T2E6 689 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L6PQ6QN14 398 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 COA1Q9GZY4 146 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PSTPIP2Q9H939 334 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNQ5Q9NR82 932 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa19.94■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L10C9JJH3 530 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 KRIT1O00522 736 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 MGRN1O60291 552 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 MED24O75448 989 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 E2F5Q15329 346 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 EDRF1Q3B7T1 1238 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT71Q3SY84 523 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMD1Q99460 953 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 AMACRQ9UHK6 382 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 F8VZ95 297 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC188H7C350 402 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PON1P27169 355 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC8A1P32418 973 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R18Q6NYC8 613 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD1Q719H9 257 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 TPCN2Q8NHX9 752 aa19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 GAKO14976 1311 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 CHRNA5P30532 468 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 EXOC3L4Q17RC7 722 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 TLDC1Q6P9B6 456 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 SWAP70Q9UH65 585 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PLIN4Q96Q06 1357 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PPIP5K2O43314 1243 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 AFPP02771 609 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC12A3P55017 1021 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMC6P62333 389 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PEX26Q7Z412 305 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 TLCD1Q96CP7 247 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa19.92■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 FRMD3A2A2Y4 597 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 TTLL1O95922 423 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 HOXD13P35453 343 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 SCNN1DP51172 638 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ERMARDQ5T6L9 678 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 TCERG1LQ5VWI1 586 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 MDM1Q8TC05 714 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC14L1Q92503 715 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPTQ96BT3 561 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 CHMP6Q96FZ7 201 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 DBNDD1Q9H9R9 158 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 MEIS1O00470 390 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 TTI1O43156 1089 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 AKAP3O75969 853 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 GABPAQ06546 454 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 GJB7Q6PEY0 223 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 RASGEF1CQ8N431 466 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC26Q8TAB7 109 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM129AQ9BZQ8 928 aa19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms