RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419249.2

AGRN-202, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 3

Gene AGRN, Length 861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-202ENST00000419249 DNM2P50570 870 aa20.49■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 NPEPPSP55786 919 aa20.49■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 IKBKEQ14164 716 aa20.49■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 LPIN1Q14693 890 aa20.49■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.49■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.49■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.49■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.49■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.49■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 EVPLQ92817 2033 aa20.49■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 GPR32O75388 356 aa20.48■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 CLCN3P51790 818 aa20.48■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 XKR9Q5GH70 373 aa20.48■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.48■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.48■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.48■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.48■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 ZBBXA8MT70 800 aa20.47■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 ZBTB39O15060 712 aa20.47■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 GHRP10912 638 aa20.47■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 RARRES1P49788 294 aa20.47■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.47■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 KRT79Q5XKE5 535 aa20.47■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 AK8Q96MA6 479 aa20.47■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 SLC9A7Q96T83 725 aa20.47■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.47■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 AKT3Q9Y243 479 aa20.47■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 SIP14410 1827 aa20.46■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 SLC26A4O43511 780 aa20.46■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 DGAT1O75907 488 aa20.46■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 PTPAQ15257 358 aa20.46■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 TCTN1Q2MV58 587 aa20.46■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 ODR4Q5SWX8 454 aa20.46■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.46■□□□□ 0.87
AGRN-202ENST00000419249 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 VTNP04004 478 aa20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 GPC3P51654 580 aa20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 KIZQ2M2Z5 673 aa20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 HYIQ5T013 277 aa20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 TCP11Q8WWU5 503 aa20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 CLIC4Q9Y696 253 aa20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 GBF1Q92538 1859 aa20.45■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 KCNJ6P48051 423 aa20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 DRP2Q13474 957 aa20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 EMC2Q15006 297 aa20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 POTEGQ6S5H5 508 aa20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 ZNF410Q86VK4 478 aa20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 DEFB123Q8N688 67 aa20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 PADI3Q9ULW8 664 aa20.44■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 ASAP2O43150 1006 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 RPS6KA5O75582 802 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 F13A1P00488 732 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 DNAJB2P25686 324 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 PAK2Q13177 524 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 SLC39A14Q15043 492 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 ECM1Q16610 540 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 ATL3Q6DD88 541 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 Q7L0L9 218 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 USP28Q96RU2 1077 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 OSMRQ99650 979 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 MTRQ99707 1265 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 PBX4Q9BYU1 374 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 GINS2Q9Y248 185 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 PTPRSQ13332 1948 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.43■□□□□ 0.86
AGRN-202ENST00000419249 PP2D1A8MPX8 630 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms