RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 PADI3Q9ULW8 664 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 GJB5O95377 273 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 CA3P07451 260 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 OR52Z1P0C646 297 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 NPEPPSP55786 919 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 TOP1MTQ969P6 601 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP170P1Q96L14 293 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 RAD9AQ99638 391 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB39O15060 712 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 PAK2Q13177 524 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS6KA5O75582 802 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 UPP2O95045 317 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 DNM2P50570 870 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 DRP2Q13474 957 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 OSMRQ99650 979 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 POTEMA6NI47 508 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR182O15218 404 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 LYPLA2O95372 231 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 PTGDRQ13258 359 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 NEK9Q8TD19 979 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 MYLIPQ8WY64 445 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 PPME1Q9Y570 386 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 INSL6Q9Y581 213 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC42EP1Q00587 391 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 XKR9Q5GH70 373 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 ODR4Q5SWX8 454 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 TMX1Q9H3N1 280 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 LCHNA4D1U4 455 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGEF15O94989 841 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 GPC3P51654 580 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 TAP1Q03518 808 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 SNX21Q969T3 373 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A087WWV3 80 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.373e-9■■■■■ 40.7
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 RFC5P40937 340 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM228AQ86W67 206 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 NLRP7Q8WX94 980 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 CERS4Q9HA82 394 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-204ENST00000416021 MED24O75448 989 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PDCP20941 246 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.363e-7■■□□□ 14.2
SH3BP4-204ENST00000416021 PDIA5Q14554 519 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ERMNQ8TAM6 284 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SCLT1Q96NL6 688 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 LAD1O00515 517 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM143Q96AN5 459 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 YME1L1Q96TA2 773 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 FOSL2P15408 326 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RPA1P27694 616 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 IL17AQ16552 155 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 KSR1Q8IVT5 923 aa23.55■■□□□ 1.36
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