RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 ST18O60284 1047 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 LPXNO60711 386 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 GUCY1B3Q02153 619 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 EPHA7Q15375 998 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 TMX1Q9H3N1 280 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 AKT3Q9Y243 479 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM150BA6NC51 233 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 WNT7AO00755 349 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 GRB10Q13322 594 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 MTERF2Q49AM1 385 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 ODR4Q5SWX8 454 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 ANO5Q75V66 913 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 PPM1EQ8WY54 764 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 OSMRQ99650 979 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR182O15218 404 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 CALCRLQ16602 461 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 SAMD11Q96NU1 681 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM228AQ86W67 206 aa23.09■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.09■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 NEMFO60524 1076 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 DGKIO75912 1065 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 GPC3P51654 580 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 C4orf19Q8IY42 314 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 MTMR9Q96QG7 549 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 LXNQ9BS40 222 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 RGL1Q9NZL6 768 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 CDC42EP1Q00587 391 aa23.08■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 DRP2Q13474 957 aa23.08■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 EPC2Q52LR7 807 aa23.08■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 FIBCD1Q8N539 461 aa23.08■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.08■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.08■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.08■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 MGEA5O60502 916 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 STAG3L1P0CL83 205 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 DNM2P50570 870 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 DYDC2Q96IM9 177 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 TMX3Q96JJ7 454 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAM2Q99965 735 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 RGS18Q9NS28 235 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 PPME1Q9Y570 386 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 SLITRK3O94933 977 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 LINC00271P0C7V0 271 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP2B1P20020 1258 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 TXKP42681 527 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 NPEPPSP55786 919 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM192Q8IY95 271 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 DENND3A2RUS2 1198 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 MCM7P33993 719 aa23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms