RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384006.1

RNU6-641P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 641, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-641P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-641P-201ENST00000384006 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 KDM1AO60341 852 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 TRIM13O60858 407 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 RGS3P49796 1198 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 TMPRSS15P98073 1019 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 CCDC178Q5BJE1 867 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 IFNL2Q8IZJ0 200 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUDT11Q96G61 164 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ACAP3Q96P50 834 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 KCNC2Q96PR1 638 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPATA25Q9BR10 227 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 TMEM168Q9H0V1 697 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 MSL2Q9HCI7 577 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 MSRAQ9UJ68 235 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 A0A0A6YYJ9 748 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 A0A0G2JNJ9 132 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 NOBOXO60393 691 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRKD3O94806 890 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 PFKMP08237 780 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 CSF2RBP32927 897 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 KCNC1P48547 511 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 GPR15P49685 360 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 GJA9P57773 515 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ERVK-21P61565 698 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 CD83Q01151 205 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ADCY2Q08462 1091 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 PHF19Q5T6S3 580 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 TRIM68Q6AZZ1 485 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 IQSEC1Q6DN90 963 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ORAI2Q96SN7 254 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 MYL10Q9BUA6 226 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 POFUT1Q9H488 388 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 Q9UFV3 132 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 VWA7Q9Y334 891 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ADAMTS20P59510 1910 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 MROH6A6NGR9 719 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 RAB11FIP3O75154 756 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 DGKDQ16760 1214 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 PLEKHH3Q7Z736 793 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 FAM124AQ86V42 546 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 FERMT2Q96AC1 680 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 SEMA4AQ9H3S1 761 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC5A4Q9NY91 659 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUMBLQ9Y6R0 609 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 TRIM75PA6NK02 468 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 OPHN1O60890 802 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ENPP1P22413 925 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 ANAPC15P60006 121 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 KRT85P78386 507 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 NFYCQ13952 458 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 VMACQ2NL98 169 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 INAVAQ3KP66 663 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 MCTP2Q6DN12 878 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 BORAQ6PGQ7 559 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-641P-201ENST00000384006 LMBR1Q8WVP7 490 aa4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms