RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCNA1P78396 465 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDK17Q00537 523 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 CNTN2Q02246 1040 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 MEA1Q16626 185 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIFAP3Q92845 792 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 MMP19Q99542 508 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 CEP72Q9P209 647 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.3□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLXNB2O15031 1838 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 H0YCG3 227 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 TGFB1I1O43294 461 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPP1R37O75864 691 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 DGAT1O75907 488 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 TGFB3P10600 412 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 KLK7P49862 253 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 GTF2A2P52657 109 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 ERVK-24P63145 666 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRT83P78385 493 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 MOGSQ13724 837 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 XKR3Q5GH77 459 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 DAW1Q8N136 415 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 CEP170P1Q96L14 293 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 FIZ1Q96SL8 496 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 DESI2Q9BSY9 194 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.29□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 DYNC1I1O14576 645 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 CLIC2O15247 247 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF5CO60282 957 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 NDUFA10O95299 355 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCP2P22307 547 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 NCKAP1LP55160 1127 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRKCEQ02156 737 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 SP4Q02446 784 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 KCNH2Q12809 1159 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 MTF1Q14872 753 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 WDR78Q5VTH9 848 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 STRA6Q9BX79 667 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 POLD4Q9HCU8 107 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF302Q9NR11 478 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.28□□□□□ -0.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 AKAP3O75969 853 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATG7O95352 703 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRT13P13646 458 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 CASQ1P31415 396 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 RTP1P59025 263 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 ERVK-9P63128 1117 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPP2R5AQ15172 486 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 PDXDC1Q6P996 788 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 GBP6Q6ZN66 633 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANO5Q75V66 913 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 IFT74Q96LB3 600 aa14.27□□□□□ -0.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 DNAI1Q9UI46 699 aa14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms