RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 FMN1Q68DA7 1419 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 CFAP74Q9C0B2 1584 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 FANCAO15360 1455 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 PDPK1O15530 556 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 KCNQ1P51787 676 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 TGFB2P61812 414 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 DGCR2P98153 550 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 GUCY1A3Q02108 690 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 RASGRF1Q13972 1273 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 FAM209AQ5JX71 171 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRC-204ENST00000367379 USP30Q70CQ3 517 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 IL17DQ8TAD2 202 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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PTPRC-204ENST00000367379 ACRV1P26436 265 aa7.24□□□□□ -1.25
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PTPRC-204ENST00000367379 CRY1Q16526 586 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.24□□□□□ -1.25
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PTPRC-204ENST00000367379 CDC6Q99741 560 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 CSRNP2Q9H175 543 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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PTPRC-204ENST00000367379 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
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PTPRC-204ENST00000367379 ECE1P42892 770 aa7.23□□□□□ -1.25
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PTPRC-204ENST00000367379 PCOLCEQ15113 449 aa7.23□□□□□ -1.25
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PTPRC-204ENST00000367379 CD83Q01151 205 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTPRC-204ENST00000367379 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTPRC-204ENST00000367379 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-204ENST00000367379 NELFAQ9H3P2 528 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTPRC-204ENST00000367379 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-204ENST00000367379 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTPRC-204ENST00000367379 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRC-204ENST00000367379 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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PTPRC-204ENST00000367379 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRC-204ENST00000367379 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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PTPRC-204ENST00000367379 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa7.19□□□□□ -1.26
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