RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 RCN2Q14257 317 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC24Q50LG9 513 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TTLL6Q8N841 843 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 DPH5Q9H2P9 285 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 K7ERI5 159 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 LRRN2O75325 713 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KRT16P08779 473 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CHRNA3P32297 505 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ELF1P32519 619 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 DDIT3P35638 169 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 VPS41P49754 854 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PLTPP55058 493 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF699Q32M78 642 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 STAMQ92783 540 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 YY1AP1Q9H869 796 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PALD1Q9ULE6 856 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 BAG2O95816 211 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MTMR1Q13613 665 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 EHD2Q9NZN4 543 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 GFPT2O94808 682 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 STAT3P40763 770 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MAPRE2Q15555 327 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CALN1Q9BXU9 219 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L8P0C7I0 530 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 GFAPP14136 432 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SLC1A1P43005 524 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 EPHB1P54762 984 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TTLL4Q14679 1199 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 IFT88Q13099 833 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 STILQ15468 1287 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TRADDQ15628 312 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RASIP1Q5U651 963 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PAGE5Q96GU1 130 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF560Q96MR9 790 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SDC4P31431 198 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SLC35F6Q8N357 371 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 DIP2AQ14689 1571 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ADORA1P30542 326 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 USP11P51784 963 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MORF4L2Q15014 288 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PIK3R2O00459 728 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KRT31Q15323 416 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 P3H1Q32P28 736 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SNX1Q13596 522 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MEIS1O00470 390 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SPAG7O75391 227 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PLS3P13797 630 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ERICH1Q86X53 443 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 BEST2Q8NFU1 509 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MCF2P10911 925 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ZWILCHQ9H900 591 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SAT1P21673 171 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NNMTP40261 264 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 COPS2P61201 443 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 OCRLQ01968 901 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 STXBP2Q15833 593 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MAPK6Q16659 721 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF827Q17R98 1081 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.42□□□□□ -1.38
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