RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 CPS1P31327 1500 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 GCLMP48507 274 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 DYNLT1P63172 113 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNH2Q12809 1159 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PDIA5Q14554 519 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO33Q7Z6M2 555 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 EFCAB13Q8IY85 973 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC8CQ8TDW0 803 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAM22Q9P0K1 906 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 LCMT1Q9UIC8 334 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM49BA6NDI0 452 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 CASP1P29466 404 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX13BQ9BXU2 312 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF609O15014 1411 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF699Q32M78 642 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 C19orf81C9J6K1 198 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 CXCR5P32302 372 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 BASP1P80723 227 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SLMAPQ14BN4 828 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 BEST2Q8NFU1 509 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM213AQ9BRX8 229 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC39CQ8N584 583 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 NRXN1Q9ULB1 1477 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFB10O96000 172 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PCK1P35558 622 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 STYK1Q6J9G0 422 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 THEM5Q8N1Q8 247 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 HUS1O60921 280 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 IL9RQ01113 521 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC16A10Q8TF71 515 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM151AQ8WW52 585 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA33Q96N06 139 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 NUF2Q9BZD4 464 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ESYT2A0FGR8 921 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 LMNTD2Q8IXW0 634 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC1Q99614 292 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC151A5D8V7 595 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC188H7C350 402 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 NXNQ6DKJ4 435 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP4F22Q6NT55 531 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 HINFPQ9BQA5 517 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 CIITAP33076 1130 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TUFT1Q9NNX1 390 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC9A2Q9UBY0 812 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 EYA4O95677 639 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMA2P25787 234 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 VAMP7P51809 220 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 MTMR2Q13614 643 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 MFSD14CQ5VZR4 134 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM42Q8IWZ5 723 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 BCAS4Q8TDM0 211 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP17.55■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 39.2
SH3BP4-201ENST00000344528 GCNAQ96QF7 691 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 CCSER1Q9C0I3 900 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBED1O96006 694 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 GPC3P51654 580 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 LLGL1Q15334 1064 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 C16orf86Q6ZW13 317 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 RHPN2Q8IUC4 686 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP17.55■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 9.5
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 STRIP2Q9ULQ0 834 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PP2D1A8MPX8 630 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 MSH2P43246 934 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNB1Q14721 858 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TKFCQ3LXA3 575 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT39Q6A163 491 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PDE11AQ9HCR9 933 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ABHD10Q9NUJ1 306 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 MYCP01106 439 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 CALB1P05937 261 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PDIA6Q15084 440 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SHC4Q6S5L8 630 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 RAPH1Q70E73 1250 aa17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms