RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 AOC2O75106 756 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 STX17P56962 302 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 STIM1Q13586 685 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SARM1Q6SZW1 724 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MAML3Q96JK9 1138 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 KCND2Q9NZV8 630 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CA12O43570 354 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 GGPS1O95749 300 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CCDC175P0C221 793 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R2P41236 205 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 APLP1P51693 650 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SPATA1Q5VX52 437 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 BORCS6Q96GS4 357 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 VTA1Q9NP79 307 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ABL2P42684 1182 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MAP2K5Q13163 448 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 NOGQ13253 232 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TTLL4Q14679 1199 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 METTL7BQ6UX53 244 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CAPNS2Q96L46 248 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 FANCLQ9NW38 375 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.68□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ALDH1A1P00352 501 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 GUCY2CP25092 1073 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CASQ1P31415 396 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MAP2K2P36507 400 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PADI6Q6TGC4 694 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SCFD2Q8WU76 684 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 KATNBL1Q9H079 304 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ZNF302Q9NR11 478 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TMEM150BA6NC51 233 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PSMA7O14818 248 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 BACH1O14867 736 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ZNF862O60290 1169 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 STBD1O95210 358 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 RSPH10BP0C881 870 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 GAP43P17677 238 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 RARRES1P49788 294 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ZNF75DP51815 510 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SFR1Q86XK3 245 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 RETREG2Q8NC44 543 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 USP6NLQ92738 828 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TINF2Q9BSI4 451 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TRIM5Q9C035 493 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MYH11P35749 1972 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 NAT2P11245 290 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PRKCEQ02156 737 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 XKR9Q5GH70 373 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ANO5Q75V66 913 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.67□□□□□ -1.34
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