RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 NEK9Q8TD19 979 aa22.72■■□□□ 1.23
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KCNQ1-202ENST00000335475 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.71■■□□□ 1.23
KCNQ1-202ENST00000335475 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.71■■□□□ 1.23
KCNQ1-202ENST00000335475 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.71■■□□□ 1.23
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KCNQ1-202ENST00000335475 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.7■■□□□ 1.23
KCNQ1-202ENST00000335475 GJB7Q6PEY0 223 aa22.7■■□□□ 1.23
KCNQ1-202ENST00000335475 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.7■■□□□ 1.23
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KCNQ1-202ENST00000335475 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-202ENST00000335475 SPP2Q13103 211 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP2R5AQ15172 486 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-202ENST00000335475 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC102AQ96A19 550 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR88Q9GZN0 384 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-202ENST00000335475 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-202ENST00000335475 ERICH4A6NGS2 130 aa22.65■■□□□ 1.22
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