RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 HES6Q96HZ4 224 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 TMBIM4Q9HC24 238 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 H0YGN5 161 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 RAD21O60216 631 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 HSD17B14Q9BPX1 270 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 EPN3Q9H201 632 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 NFS1Q9Y697 457 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 FAM196BA6NMK8 535 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 EML1O00423 815 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFAB1O14561 156 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 CYP4A11Q02928 519 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 PODNQ7Z5L7 613 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 SYT11Q9BT88 431 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R37O75864 691 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 HSD17B3P37058 310 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 ATP1A2P50993 1020 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
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HOXD1-201ENST00000331462 FAM186BQ8IYM0 893 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 F8VZ95 297 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 LMNB1P20700 586 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 SOX5P35711 763 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 KCNA1Q09470 495 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 USH1GQ495M9 461 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 STK33Q9BYT3 514 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 KRIT1O00522 736 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM253P0C7T8 217 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 MUTP22033 750 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 MDH1P40925 334 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 MTMR3Q13615 1198 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 CEP85LQ5SZL2 805 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 CLIC2O15247 247 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 EVI5O60447 810 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 BMP3P12645 472 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF131P52739 623 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 TCP10Q12799 353 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 PTGISQ16647 500 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 GJB7Q6PEY0 223 aa24.54■■□□□ 1.52
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HOXD1-201ENST00000331462 RFFLQ8WZ73 363 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 FAM13AO94988 1023 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 ALDH1B1P30837 517 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 CACNB3P54284 484 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 GALCP54803 685 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 SNAP25P60880 206 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 PPP2R5CQ13362 524 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 DMAC2Q9NW81 257 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 RGL1Q9NZL6 768 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 FMO5P49326 533 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 BIRC3Q13489 604 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 PPP2R5AQ15172 486 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 DAAM2Q86T65 1068 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 FIZ1Q96SL8 496 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 PARVGQ9HBI0 331 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 GGA2Q9UJY4 613 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 PSMD10O75832 226 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 MYZAPP0CAP1 466 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 GUCY1A3Q02108 690 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 TRAF1Q13077 416 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 NEUROG2Q9H2A3 272 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 KCND2Q9NZV8 630 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 AMFRQ9UKV5 643 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 G3V3G9 751 aa24.52■■□□□ 1.52
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