RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326039.3

GRTP1-201, Transcript of growth hormone regulated TBC protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GRTP1, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1-201ENST00000326039 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.02■■□□□ 1.28
GRTP1-201ENST00000326039 CDH23Q9H251 3354 aa23.02■■□□□ 1.28
GRTP1-201ENST00000326039 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.01■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 MYOGP15173 224 aa23.01■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 CD52P31358 61 aa23.01■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 KIZQ2M2Z5 673 aa23.01■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.01■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 NEK9Q8TD19 979 aa23.01■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 CEP170P1Q96L14 293 aa23.01■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.01■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 TANC1Q9C0D5 1861 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 KAT6AQ92794 2004 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 DLL1O00548 723 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 ENPP3O14638 875 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 SYT1P21579 422 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 DRP2Q13474 957 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 PDIA5Q14554 519 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF710Q8N1W2 664 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 TMEM40Q8WWA1 233 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 PADI3Q9ULW8 664 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 AKT3Q9Y243 479 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 GINS2Q9Y248 185 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 PPME1Q9Y570 386 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 EYSQ5T1H1 3165 aa23■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 LAD1O00515 517 aa22.99■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 IL17AQ16552 155 aa22.99■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 MAP7D2Q96T17 732 aa22.99■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.99■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.99■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 A0A087WWV3 80 aa22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 MED24O75448 989 aa22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 AMHP03971 560 aa22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 DNM2P50570 870 aa22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 BRAPQ7Z569 592 aa22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 HSCBQ8IWL3 235 aa22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 TOP1MTQ969P6 601 aa22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 OSMRQ99650 979 aa22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF576Q9H609 170 aa22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.98■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 GJB5O95377 273 aa22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 FOSL2P15408 326 aa22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 RPA1P27694 616 aa22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 PRPHP41219 470 aa22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 GPC3P51654 580 aa22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 CDC42EP1Q00587 391 aa22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 XKR9Q5GH70 373 aa22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 TLL1O43897 1013 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 RPS6KA5O75582 802 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 RFC5P40937 340 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 PAK2Q13177 524 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 FERMT3Q86UX7 667 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 ERMNQ8TAM6 284 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 RAD9AQ99638 391 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 TMX1Q9H3N1 280 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.96■■□□□ 1.27
GRTP1-201ENST00000326039 GPR182O15218 404 aa22.95■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.95■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.95■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.95■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 MTMR6Q9Y217 621 aa22.95■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 CA3P07451 260 aa22.94■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 RARRES1P49788 294 aa22.94■■□□□ 1.26
GRTP1-201ENST00000326039 ECM1Q16610 540 aa22.94■■□□□ 1.26
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