RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM102BQ5T8I3 360 aa30.4■■■□□ 2.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF180Q86T96 592 aa30.4■■■□□ 2.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MLKLQ8NB16 471 aa30.4■■■□□ 2.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARVGQ9HBI0 331 aa30.4■■■□□ 2.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYADML2A6NDP7 307 aa30.39■■■□□ 2.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAMTS4O75173 837 aa30.39■■■□□ 2.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MFSD10Q14728 455 aa30.39■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MYCT1Q8N699 235 aa30.39■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RSPH10BP0C881 870 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 INSRRP14616 1297 aa30.38■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJC25Q9H1X3 360 aa30.38■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SEL1LQ9UBV2 794 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL1A2P08123 1366 aa30.37■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM26FQ5R3K3 315 aa30.37■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SFI1A8K8P3 1242 aa30.37■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IGBP1P78318 339 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 SFR1Q86XK3 245 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 KAT2BQ92831 832 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC39A2Q9NP94 309 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAS2O43903 313 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PDLIM7Q9NR12 457 aa30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 RRN3P2A6NIE6 340 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF131P52739 623 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 ODR4Q5SWX8 454 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP89Q96ST8 783 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNC93B1Q9H1C4 597 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GRIK4Q16099 956 aa30.34■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa30.34■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HPS3Q969F9 1004 aa30.34■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF165P49910 485 aa30.33■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf75Q9HAS0 396 aa30.33■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 C7orf31Q8N865 590 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM143Q96AN5 459 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF208Q9H0X6 261 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 OLFML3Q9NRN5 406 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRCAMQ92823 1304 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARID2Q68CP9 1835 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCL5P13501 91 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLRC1P26715 233 aa30.32■■■□□ 2.44
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