RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM119Q4V9L6 283 aa10.15□□□□□ -0.78
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PDE4D-201ENST00000309641 SPATA32Q96LK8 384 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-201ENST00000309641 AK8Q96MA6 479 aa10.15□□□□□ -0.78
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PDE4D-201ENST00000309641 NT5C3AQ9H0P0 336 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-201ENST00000309641 ADAMTS10Q9H324 1103 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-201ENST00000309641 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-201ENST00000309641 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-201ENST00000309641 STK24Q9Y6E0 443 aa10.12□□□□□ -0.79
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PDE4D-201ENST00000309641 SFI1A8K8P3 1242 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-201ENST00000309641 DGAT1O75907 488 aa10.11□□□□□ -0.79
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