RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KynuQ9CXF0 464 aa13.81□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PycardQ9EPB4 193 aa13.81□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef7Q9ES28 862 aa13.81□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Add1Q9QYC0 735 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abhd15Q5F2F2 459 aa13.81□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhx37Q6NZL1 1150 aa13.81□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rusc1Q8BG26 893 aa13.81□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Def6Q8C2K1 630 aa13.81□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc113Q8C5T8 377 aa13.81□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Galnt15Q9D2N8 638 aa13.81□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec14l1A8Y5H7 715 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akr1b10G5E895 316 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gucy1b3O54865 620 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc16a2O70324 545 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Idh1O88844 414 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdrg1P59048 133 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmtc1Q3UV71 942 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf827Q505G8 1078 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcph1Q7TT79 822 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LgsnQ8CIX8 563 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr805Q8VFI4 319 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex21Q9R0U9 575 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pex11aQ9Z211 246 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kmt2eQ3UG20 1868 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Skor2A7M7C7 1008 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700018F24RikB2RW27 314 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AunipE9Q6Z5 340 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nmt1O70310 496 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UgcgO88693 394 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pbxip1Q3TVI8 727 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rufy4Q3TYX8 563 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd19Q562E2 927 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exoc3Q6KAR6 755 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sez6lQ6P1D5 963 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Baiap3Q80TT2 1134 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Maip1Q8BHE8 291 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Senp7Q8BUH8 1037 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DnerQ8JZM4 737 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mmgt1Q8K273 131 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stard7Q8R1R3 373 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx10Q9CWT3 201 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb3bQ9D1Q5 387 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmod4Q9JLH8 345 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc26a4Q9R155 780 aa13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Orc1Q9Z1N2 840 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PatjQ63ZW7 1834 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pip4k2aO70172 405 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd44P15379 778 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxc10P31257 342 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp2r5cQ60996 524 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AopepQ8BXQ6 817 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lca5lQ8C0X0 741 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rcor2Q8C796 523 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Angel2Q8K1C0 544 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PdgfdQ925I7 370 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pstpip2Q99M15 334 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plagl1Q9JLQ4 704 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm28919A0A087WP35 240 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim55G3X8Y1 545 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prom1O54990 867 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Got1P05201 413 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd68P31996 326 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam83hQ148V8 1209 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hdhd2Q3UGR5 259 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapk6Q61532 720 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ces1eQ64176 562 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tlr11Q6R5P0 926 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmc3Q7TQ69 1130 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sun2Q8BJS4 731 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kdm4bQ91VY5 1086 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syce1Q9D495 329 aa13.79□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhdc7aA2APT9 773 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem63bQ3TWI9 832 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpd2Q64521 727 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phf8Q80TJ7 1023 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcp10aQ80W76 438 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trap1Q9CQN1 706 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11549A0A286YD83 63 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r79E9Q067 851 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gjc1P28229 396 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lig1P37913 916 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtgdrP70263 357 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HmmrQ00547 794 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd37Q61470 281 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd24Q80VM7 985 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2sQ921J4 223 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PpihQ9D868 188 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eya4Q9Z191 616 aa13.78□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P4hbP09103 509 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pik3r1P26450 724 aa13.77□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamts10P58459 1104 aa13.77□□□□□ -0.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.1 ms