RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.54	□□□□□ -1.52	not detected
GPT2	YKR067W	YNR014W	P53719	212 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	YPL080C	Q02826	108 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	YDR239C	Q03780	787 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	SWF1	Q04629	336 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	RRG8	Q06109	277 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	YPQ2	Q06328	317 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	YPR127W	Q06494	345 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	ECM30	Q06673	1274 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	BAG7	Q12128	409 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	SUT2	Q12286	268 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	PET20	Q99373	253 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	ATP6	P00854	259 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	YKL071W	P36086	256 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	TSC10	P38342	320 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	RPH1	P39956	796 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	FCY21	P40039	528 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	SER3	P40054	469 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	YJR124C	P47159	448 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	MRM2	P53123	320 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	VPS62	P53285	467 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	MFG1	Q07684	458 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	CRT10	Q08226	957 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	YPR202W	Q08993	238 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GPT2	YKR067W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	GPA2	P10823	449 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	GAL3	P13045	520 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	SNA3	P14359	133 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	SAC7	P17121	654 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	VRG4	P40107	337 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	POG1	P40473	351 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	YAR1	P46683	200 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	GPI1	P53306	609 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	YNL140C	P53910	189 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	SNX41	Q04053	625 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	HRD3	Q05787	833 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	YPR091C	Q06833	770 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	MAS1	P10507	462 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	AMD2	P22580	549 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	IML3	P38265	245 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	FAD1	P38913	306 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	GUF1	P46943	645 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	GLO1	P50107	326 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	TIM13	P53299	105 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	YDR476C	Q03362	224 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	TVP15	Q03860	143 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	FIN1	Q03898	291 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	RGS2	Q99188	309 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	CDC26	P14724	124 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	MSN1	P22148	382 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	YKL107W	P34251	309 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	CTP1	P38152	299 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	ICS2	P38284	255 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	ATG12	P38316	186 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	STB1	P42845	420 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	IDS2	P46958	469 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	BIT61	P47041	543 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	YJR149W	P47177	404 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	TNA1	P53322	534 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	ISU1	Q03020	165 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	BCH1	Q05029	724 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	GPM2	Q12008	311 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	OCA6	Q12454	224 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	TOR1	P35169	2470 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	TPK2	P06245	380 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	HMG2	P12684	1045 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	SAG1	P20840	650 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	UBC8	P28263	218 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	SYN8	P31377	255 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	TAF14	P35189	244 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	YBL029W	P38201	376 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	ECM8	P38246	354 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	SAP30	P38429	201 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GPT2	YKR067W	YEL028W	P39989	153 aa		5.51	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.1 ms