RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	ARG81	P05085	880 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
MRP4	YHL004W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	DAL81	P21657	970 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	DCC1	P25559	380 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	AEP1	P32493	518 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	GDA1	P32621	518 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ECM4	P36156	370 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PHO89	P38361	574 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MLH1	P38920	769 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YEL020C	P39994	560 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	HEM14	P40012	539 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YIL077C	P40508	320 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	STB2	P46679	850 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	GTO1	P48239	356 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	TIM13	P53299	105 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	BUD32	P53323	261 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YAT1	P80235	687 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	TVP15	Q03860	143 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	COS7	Q07788	383 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	NDD1	Q08887	554 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SRN2	Q99176	213 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YPR089W	O13585	888 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ABF1	P14164	731 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	UGA1	P17649	471 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	EXO70	P19658	623 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YCR061W	P25639	631 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	BEM1	P29366	551 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ECM25	P32525	599 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	FZO1	P38297	855 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	STN1	P38960	494 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	FRT2	P39734	528 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SER3	P40054	469 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YRB2	P40517	327 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	UBX6	P47049	396 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ECM27	P47144	725 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MRM2	P53123	320 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	VOA1	P53262	265 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SPP2	Q02521	185 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	GTO3	Q04806	366 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	DCS1	Q06151	350 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	CRN1	Q06440	651 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MLH3	Q12083	715 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MTR10	Q99189	972 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	CCH1	P50077	2039 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	HEM2	P05373	342 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RHO2	P06781	192 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PRB1	P09232	635 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SPS4	P09937	338 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	REV1	P12689	985 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PMR1	P13586	950 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	NMT1	P14743	455 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	CDC23	P16522	626 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PMA2	P19657	947 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RBK1	P25332	333 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	GEX1	P25596	615 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SIP1	P32578	815 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YKL070W	P36087	169 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	GEX2	P36173	615 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	CTP1	P38152	299 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	LDB7	P38210	180 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YMR262W	P38430	313 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RPH1	P39956	796 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ALG8	P40351	577 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MSS2	P40990	351 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	AIM23	P47015	356 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	BOL2	P53082	120 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	FLC3	P53121	802 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YGR126W	P53274	230 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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