RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 GRIN2CQ14957 1233 aa25.17■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.17■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.17■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 UGCGQ16739 394 aa25.16■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 FBXO47Q5MNV8 452 aa25.16■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.16■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 HAS1Q92839 578 aa25.16■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 TMX3Q96JJ7 454 aa25.16■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 GINS2Q9Y248 185 aa25.16■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 C22orf31O95567 290 aa25.15■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 CA3P07451 260 aa25.15■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 LPIN1Q14693 890 aa25.15■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 CALCRLQ16602 461 aa25.15■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 USP38Q8NB14 1042 aa25.15■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 VAV3Q9UKW4 847 aa25.15■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.14■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 GJB5O95377 273 aa25.14■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 ATP2B1P20020 1258 aa25.14■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 TMOD1P28289 359 aa25.14■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 XKR3Q5GH77 459 aa25.14■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.14■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 MYLIPQ8WY64 445 aa25.14■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 SQORQ9Y6N5 450 aa25.14■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 NEMFO60524 1076 aa25.14■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 PSMC5P62195 406 aa25.14■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.14■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa25.14■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 BANK1Q8NDB2 785 aa25.14■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 EML1O00423 815 aa25.13■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 FOSL2P15408 326 aa25.13■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.13■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 MAP7D2Q96T17 732 aa25.13■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 RAD9AQ99638 391 aa25.13■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.13■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 GBF1Q92538 1859 aa25.12■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa25.12■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 NCAPH2Q6IBW4 605 aa25.12■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 EFCAB12Q6NXP0 572 aa25.12■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 CD52P31358 61 aa25.11■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 PAK2Q13177 524 aa25.11■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 EPHA7Q15375 998 aa25.11■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.11■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 AKT3Q9Y243 479 aa25.11■■□□□ 1.61
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SYT6-210ENST00000641643 WDR81Q562E7 1941 aa25.1■■□□□ 1.61
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SYT6-210ENST00000641643 CLCN3P51790 818 aa25.1■■□□□ 1.61
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SYT6-210ENST00000641643 FTHL17Q9BXU8 183 aa25.1■■□□□ 1.61
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SYT6-210ENST00000641643 PRDM12Q9H4Q4 367 aa25.1■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 INSL6Q9Y581 213 aa25.1■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 MICAL3Q7RTP6 2002 aa25.1■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 COL6A3P12111 3177 aa25.1■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 VTNP04004 478 aa25.1■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 NOSTRINQ8IVI9 506 aa25.1■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 LRRC71Q8N4P6 559 aa25.1■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 TOP1MTQ969P6 601 aa25.1■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 UPP2O95045 317 aa25.09■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 TXKP42681 527 aa25.09■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 KIZQ2M2Z5 673 aa25.09■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 ODR4Q5SWX8 454 aa25.09■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 PPP1R16BQ96T49 567 aa25.09■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 LXNQ9BS40 222 aa25.09■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 PADI3Q9ULW8 664 aa25.09■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 WNT7AO00755 349 aa25.08■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 RPS6KA5O75582 802 aa25.08■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 ZNF710Q8N1W2 664 aa25.08■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 YME1L1Q96TA2 773 aa25.08■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.08■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.08■■□□□ 1.61
SYT6-210ENST00000641643 GJB2P29033 226 aa25.07■■□□□ 1.6
SYT6-210ENST00000641643 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SYT6-210ENST00000641643 TAP1Q03518 808 aa25.07■■□□□ 1.6
SYT6-210ENST00000641643 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.07■■□□□ 1.6
SYT6-210ENST00000641643 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SYT6-210ENST00000641643 OSMRQ99650 979 aa25.07■■□□□ 1.6
SYT6-210ENST00000641643 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.07■■□□□ 1.6
SYT6-210ENST00000641643 CERS4Q9HA82 394 aa25.07■■□□□ 1.6
SYT6-210ENST00000641643 RGL1Q9NZL6 768 aa25.07■■□□□ 1.6
SYT6-210ENST00000641643 LCHNA4D1U4 455 aa25.06■■□□□ 1.6
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