RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623333.1

AP000997.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AP000997.3, Length 2,250 nt, Biotype TEC.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000997.3-201ENST00000623333 SKOR1P84550 965 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 CYP4A11Q02928 519 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 C2orf54Q08AI8 447 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 GPR162Q16538 588 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 UNC13DQ70J99 1090 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 CHMP2AO43633 222 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 PSMD10O75832 226 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 FDX1P10109 184 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 RPA1P27694 616 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 REPS2Q8NFH8 660 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC5A5Q92911 643 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 A6NNZ2 444 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 PSMA7O14818 248 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 OPA1O60313 960 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 ITGB5P18084 799 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 EPHX2P34913 555 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 GHRHRQ02643 423 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 NSMFQ6X4W1 530 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 CREG2Q8IUH2 290 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 RGL1Q9NZL6 768 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 OTOFQ9HC10 1997 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 RPTORQ8N122 1335 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 MOB2Q70IA6 237 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 RNF146Q9NTX7 359 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 CSADQ9Y600 493 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 RLFQ13129 1914 aa20.19■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 CNPY4Q8N129 248 aa20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 THAP9Q9H5L6 903 aa20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC26A4O43511 780 aa20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 GAS7O60861 476 aa20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 DNM2P50570 870 aa20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 ALS2CLQ60I27 953 aa20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 GPBP1Q86WP2 473 aa20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 SNX12Q9UMY4 172 aa20.18■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 USP8P40818 1118 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 TREML2Q5T2D2 321 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 CDCA5Q96FF9 252 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 ELP3Q9H9T3 547 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 JADE2Q9NQC1 790 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 PNMA2Q9UL42 364 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 DNM3Q9UQ16 869 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 WDR90Q96KV7 1748 aa20.17■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 RASSF10A6NK89 507 aa20.16■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 PRLRP16471 622 aa20.16■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC12A3P55017 1021 aa20.16■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.16■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 TTI2Q6NXR4 508 aa20.16■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 RETREG2Q8NC44 543 aa20.16■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.16■□□□□ 0.82
AP000997.3-201ENST00000623333 TRIM47Q96LD4 638 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms