RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 ZMYND10O75800 440 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 USP40Q9NVE5 1235 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ITKQ08881 620 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 KCTD6Q8NC69 237 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 MAN1B1Q9UKM7 699 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 SNAP25P60880 206 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 MED10Q9BTT4 135 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 VPS50Q96JG6 964 aa7.44□□□□□ -1.22
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