RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 EFHBQ8N7U6 833 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 WNT8BQ93098 351 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 TOP1MTQ969P6 601 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 C8orf76Q96K31 380 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 IWS1Q96ST2 819 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ALG1Q9BT22 464 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 LAMA1P25391 3075 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 A6NJR5 290 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 LARGE1O95461 756 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 MMP1P03956 469 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 MYL3P08590 195 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFV1P49821 464 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CPT1AP50416 773 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 HSD17B4P51659 736 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 RPS6P62753 249 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CUL4AQ13619 759 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ANGPT1Q15389 498 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 EEPD1Q7L9B9 569 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 IGFLR1Q9H665 355 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 VTA1Q9NP79 307 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.86□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 NFIBO00712 420 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 AMHP03971 560 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 RB1P06400 928 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 DNAJB1P25685 340 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CCND2P30279 289 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 KRT2P35908 639 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 PDE4DQ08499 809 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 GNPTABQ3T906 1256 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 BLIDQ8IZY5 108 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 DCLK2Q8N568 766 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CDHR1Q96JP9 859 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 RMDN3Q96TC7 470 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.85□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 TENM4Q6N022 2769 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 PI15O43692 258 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 NPR3P17342 541 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 GJB2P29033 226 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CTNNB1P35222 781 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 BMPR1AP36894 532 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 STXBP2Q15833 593 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 NLRX1Q86UT6 975 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ATP8B4Q8TF62 1192 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 KAT2BQ92831 832 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 YME1L1Q96TA2 773 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 NOD1Q9Y239 953 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 PATJQ8NI35 1801 aa8.84□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.84□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 JAK2O60674 1132 aa8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 CTDNEP1O95476 244 aa8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms