RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	DHX58	Q96C10	678 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-211	ENST00000582232	CEP89	Q96ST8	783 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-211	ENST00000582232	PLIN2	Q99541	437 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-211	ENST00000582232	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-211	ENST00000582232	TNMD	Q9H2S6	317 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-211	ENST00000582232	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-211	ENST00000582232	DACT1	Q9NYF0	836 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-211	ENST00000582232	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	KBTBD13	C9JR72	458 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	PLA2G4B	P0C869	781 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	HOXC8	P31273	242 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	SV2B	Q7L1I2	683 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	SESTD1	Q86VW0	696 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	KCND2	Q9NZV8	630 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	NRCAM	Q92823	1304 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232		A0A087WWV3	80 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MYL1	P05976	194 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	INSRR	P14616	1297 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MARK3	P27448	753 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	NPEPPS	P55786	919 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	AMPD3	Q01432	767 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MCM6	Q14566	821 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	XKR9	Q5GH70	373 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	CNNM3	Q8NE01	707 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	CEP170P1	Q96L14	293 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MTR	Q99707	1265 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	TRPC6	Q9Y210	931 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232		A0A1W2PQY0	241 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM150B	A6NC51	233 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	DGAT1	O75907	488 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	COL6A1	P12109	1028 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	GUCY2C	P25092	1073 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	RFC5	P40937	340 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	ADAM17	P78536	824 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	PPFIA1	Q13136	1202 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	ARSH	Q5FYA8	562 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	PAGE5	Q96GU1	130 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	ABHD8	Q96I13	439 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	GRIN2D	O15399	1336 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	EVPL	Q92817	2033 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MAGEB2	O15479	319 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	GNAT1	P11488	350 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	CYP11B2	P19099	503 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	ITGA7	Q13683	1181 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	GRIK4	Q16099	956 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MTERF2	Q49AM1	385 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	PADI6	Q6TGC4	694 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	C7orf31	Q8N865	590 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232	MYH11	P35749	1972 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-211	ENST00000582232		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36

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