RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 RIT2Q99578 217 aa18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 OSBPL7Q9BZF2 842 aa18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHA4Q9UN74 947 aa18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 GINS2Q9Y248 185 aa18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 GAS7O60861 476 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 DGKIO75912 1065 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 JAK3P52333 1124 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 METTL13Q8N6R0 699 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 MAP7D2Q96T17 732 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PDRG1Q9NUG6 133 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 GABBR1Q9UBS5 961 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 SIP14410 1827 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 DENND3A2RUS2 1198 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 RDM1Q8NG50 284 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 TEKT3Q9BXF9 490 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 DISC1Q9NRI5 854 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 CDC42EP1Q00587 391 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD1Q15327 319 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 LEXMQ3ZCV2 418 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 LRCH2Q5VUJ6 765 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 TBCKQ8TEA7 893 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 P2RX5Q93086 422 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 AAASQ9NRG9 546 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 NCOR1O75376 2440 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 KCNA5P22460 613 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 SARSP49591 514 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 Q4G0T1 1027 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 MOXD1Q6UVY6 613 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 SLC24A5Q71RS6 500 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 BLIDQ8IZY5 108 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 MSH4O15457 936 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 PPFIA3O75145 1194 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 C22orf31O95567 290 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 OATP04181 439 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 ANAPC15P60006 121 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 KRT25Q7Z3Z0 450 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 DAGLBQ8NCG7 672 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 WASF1Q92558 559 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 AKT3Q9Y243 479 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 XIRP2A4UGR9 3374 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 HOXA2O43364 376 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 DNM2P50570 870 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 STK3Q13188 491 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 EP400NLQ6ZTU2 488 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 MIER3Q7Z3K6 550 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 SLC5A5Q92911 643 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 LENG9Q96B70 501 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 UIMC1Q96RL1 719 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 ERVK-5Q9HDB9 667 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 RGS18Q9NS28 235 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 MUC3AQ02505 3323 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 CHMP2AO43633 222 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 MMP1P03956 469 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 ATP4AP20648 1035 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 CYP3A7P24462 503 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 KIZQ2M2Z5 673 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 TCEAL5Q5H9L2 206 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 SCLT1Q96NL6 688 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 ADAM2Q99965 735 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-211ENST00000568829 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms