RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VWA5AO00534 786 aa23.42■■□□□ 1.34
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PJA2O43164 708 aa23.42■■□□□ 1.34
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.42■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PADI6Q6TGC4 694 aa23.42■■□□□ 1.34
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.42■■□□□ 1.34
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.41■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C12orf42Q96LP6 360 aa23.41■■□□□ 1.34
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POLD4Q9HCU8 107 aa23.41■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.41■■□□□ 1.34
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.4■■□□□ 1.34
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.4■■□□□ 1.34
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TLR2O60603 784 aa23.39■■□□□ 1.33
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BORCS6Q96GS4 357 aa23.39■■□□□ 1.33
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.39■■□□□ 1.33
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC151A5D8V7 595 aa23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PON1P27169 355 aa23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCND2P30279 289 aa23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CASP4P49662 377 aa23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT76Q01546 638 aa23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NSMFQ6X4W1 530 aa23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RDM1Q8NG50 284 aa23.38■■□□□ 1.33
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