RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	GRM7	Q14831	915 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC181	Q5TID7	509 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	KLF4	O43474	513 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	MARCH6	O60337	910 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK4	P11802	303 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP2B1	P20020	1258 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	CD38	P28907	300 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGS2	P35354	604 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	CRHR2	Q13324	411 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	TUSC3	Q13454	348 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	DDR2	Q16832	855 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR135	Q8IZ08	494 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	D2HGDH	Q8N465	521 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	IER2	Q9BTL4	223 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR27	Q9NS67	375 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AKAP13-223	ENST00000560957	ZAR1L	A6NP61	321 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	PROB1	E7EW31	1015 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	PCOLCE	Q15113	449 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SDE2	Q6IQ49	451 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	USP30	Q70CQ3	517 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SGSM3	Q96HU1	749 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMD1	Q99460	953 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	TMX1	Q9H3N1	280 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ST7	Q9NRC1	585 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	TBX22	Q9Y458	520 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	NTRK3	Q16288	839 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	OSBP2	Q969R2	916 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	JAM3	Q9BX67	310 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO10	Q9UK96	956 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	AGRP	O00253	132 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAF5	O00463	557 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB11FIP3	O75154	756 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	LTF	P02788	710 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGCR	P04035	888 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	FGFR1	P11362	822 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE6A	P16499	860 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	EPHA5	P54756	1037 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	IGBP1	P78318	339 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	LBX2	Q6XYB7	198 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	USP53	Q70EK8	1073 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	HAS1	Q92839	578 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	LENG9	Q96B70	501 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC26A4	O43511	780 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS6KA4	O75676	772 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	GRK2	P25098	689 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	HSD3B2	P26439	372 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	GRK3	P35626	688 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	HGFAC	Q04756	655 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB33A	Q14088	237 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79

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