RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 ITGA7Q13683 1181 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 HIC1Q14526 733 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCM6Q14566 821 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAD54LQ92698 747 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 SETD4Q9NVD3 440 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 STK17AQ9UEE5 414 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 NR1I2O75469 434 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF202O95125 648 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLA2G4BP0C869 781 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGBP1P78318 339 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPFIA1Q13136 1202 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 LONRF3Q496Y0 759 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 C7orf31Q8N865 590 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 IQUBQ8NA54 791 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEP170P1Q96L14 293 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEP89Q96ST8 783 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL6A1P12109 1028 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 CAPN2P17655 700 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 GRIK4Q16099 956 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 EVPLQ92817 2033 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC12A3P55017 1021 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNS4Q8IZW8 715 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPT2Q8TD30 523 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 STAMQ92783 540 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL1A2P08123 1366 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 HOXC8P31273 242 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTRQ99707 1265 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 DACT1Q9NYF0 836 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 NRCAMQ92823 1304 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARVCFO00192 962 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLFN14P0C7P3 912 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 KLRC1P26715 233 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADAM17P78536 824 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 PADI6Q6TGC4 694 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 SV2BQ7L1I2 683 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 SESTD1Q86VW0 696 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 CUEDC2Q9H467 287 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 C22orf31O95567 290 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP11B2P19099 503 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDK7P50613 346 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 SOX10P56693 466 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARSHQ5FYA8 562 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNNM3Q8NE01 707 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP25Q9UHP3 1055 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYMKA6NI61 221 aa20.77■□□□□ 0.91
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.77■□□□□ 0.91
USP3-AS1-203ENST00000559737 TREHO43280 583 aa20.77■□□□□ 0.91
USP3-AS1-203ENST00000559737 AFMP43652 599 aa20.77■□□□□ 0.91
USP3-AS1-203ENST00000559737 NFKBIBQ15653 356 aa20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms