RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 EXOC4Q96A65 974 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 GCNT4Q9P109 453 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 SHTN1A0MZ66 631 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 GAS7O60861 476 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 DLGAP5Q15398 846 aa23.23■■□□□ 1.31
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TMEM260-216ENST00000557657 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
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TMEM260-216ENST00000557657 TRIM49CP0CI26 452 aa23.21■■□□□ 1.31
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TMEM260-216ENST00000557657 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.2■■□□□ 1.3
TMEM260-216ENST00000557657 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.2■■□□□ 1.3
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TMEM260-216ENST00000557657 VCPKMTQ9H867 229 aa23.19■■□□□ 1.3
TMEM260-216ENST00000557657 PARVGQ9HBI0 331 aa23.19■■□□□ 1.3
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TMEM260-216ENST00000557657 VIPAS39Q9H9C1 493 aa23.18■■□□□ 1.3
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TMEM260-216ENST00000557657 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.18■■□□□ 1.3
TMEM260-216ENST00000557657 ODR4Q5SWX8 454 aa23.18■■□□□ 1.3
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC70Q6NSX1 233 aa23.18■■□□□ 1.3
TMEM260-216ENST00000557657 GMLQ99445 158 aa23.18■■□□□ 1.3
TMEM260-216ENST00000557657 FAM153BP0C7A2 387 aa23.17■■□□□ 1.3
TMEM260-216ENST00000557657 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TMEM260-216ENST00000557657 FAM153CQ494X1 144 aa23.17■■□□□ 1.3
TMEM260-216ENST00000557657 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.17■■□□□ 1.3
TMEM260-216ENST00000557657 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.17■■□□□ 1.3
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