RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 CFBP00751 764 aa24.75■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 EPB41P11171 864 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 TNFRSF8P28908 595 aa24.75■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.75■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.75■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.75■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 GOLGA6BA6NDN3 693 aa24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 GAP43P17677 238 aa24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 LRCH2Q5VUJ6 765 aa24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 DYDC2Q96IM9 177 aa24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 CHMP2AO43633 222 aa24.74■■□□□ 1.55
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RCCD1-208ENST00000557266 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.74■■□□□ 1.55
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RCCD1-208ENST00000557266 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 BORCS6Q96GS4 357 aa24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 TMX2Q9Y320 296 aa24.74■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.73■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 ZBTB39O15060 712 aa24.73■■□□□ 1.55
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RCCD1-208ENST00000557266 EPHB4P54760 987 aa24.73■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 PPP2R5CQ13362 524 aa24.73■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.73■■□□□ 1.55
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RCCD1-208ENST00000557266 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
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RCCD1-208ENST00000557266 CCDC174Q6PII3 467 aa24.73■■□□□ 1.55
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RCCD1-208ENST00000557266 CNKSR1Q969H4 720 aa24.73■■□□□ 1.55
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RCCD1-208ENST00000557266 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.73■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 FAM13AO94988 1023 aa24.72■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 EMBQ6PCB8 327 aa24.72■■□□□ 1.55
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RCCD1-208ENST00000557266 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.72■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
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RCCD1-208ENST00000557266 POLR2MP0CAP2 368 aa24.71■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 UBXN2AP68543 259 aa24.71■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.71■■□□□ 1.55
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RCCD1-208ENST00000557266 NENFQ9UMX5 172 aa24.71■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 CLRN2A0PK11 232 aa24.71■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 GLI1P08151 1106 aa24.71■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 TRAF1Q13077 416 aa24.71■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 GJB7Q6PEY0 223 aa24.71■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 CAVIN3Q969G5 261 aa24.71■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
RCCD1-208ENST00000557266 GOPCQ9HD26 462 aa24.71■■□□□ 1.55
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RCCD1-208ENST00000557266 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.7■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 PPIP5K2O43314 1243 aa24.7■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 SPDYE6P0CI01 402 aa24.7■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa24.7■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 FIZ1Q96SL8 496 aa24.7■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 GDF3Q9NR23 364 aa24.7■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 PRELPP51888 382 aa24.7■■□□□ 1.54
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RCCD1-208ENST00000557266 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.7■■□□□ 1.54
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RCCD1-208ENST00000557266 NFIL3Q16649 462 aa24.69■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 KSR1Q8IVT5 923 aa24.69■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 FAM186BQ8IYM0 893 aa24.69■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.69■■□□□ 1.54
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RCCD1-208ENST00000557266 CEP55Q53EZ4 464 aa24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 MTFR1LQ9H019 292 aa24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 SHTN1A0MZ66 631 aa24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 FLOT1O75955 427 aa24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF131P52739 623 aa24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 IFT20Q8IY31 132 aa24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 SH3GL2Q99962 352 aa24.68■■□□□ 1.54
RCCD1-208ENST00000557266 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
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