RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556478.2

ATL1-209, Transcript of atlastin GTPase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATL1, Length 644 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1-209ENST00000556478 SCRN1Q12765 414 aa22.99■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.99■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 HLA-CQ95604 372 aa22.99■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.99■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.99■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 COL1A2P08123 1366 aa22.99■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 COL4A6Q14031 1691 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 TNFRSF10AO00220 468 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 GAS7O60861 476 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 CTNNB1P35222 781 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 USP11P51784 963 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 AAK1Q2M2I8 961 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 NME8Q8N427 588 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 SAMD11Q96NU1 681 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 DISC1Q9NRI5 854 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.98■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 WDR64B1ANS9 1081 aa22.97■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 VTNP04004 478 aa22.97■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 BMP1P13497 986 aa22.97■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.97■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 COG5Q9UP83 839 aa22.97■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.97■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 C22orf31O95567 290 aa22.96■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 CLCN3P51790 818 aa22.96■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 UGCGQ16739 394 aa22.96■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 INF2Q27J81 1249 aa22.96■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 KIZQ2M2Z5 673 aa22.96■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 SLC5A5Q92911 643 aa22.96■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 OSMRQ99650 979 aa22.96■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 TMX1Q9H3N1 280 aa22.96■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 SQORQ9Y6N5 450 aa22.96■■□□□ 1.27
ATL1-209ENST00000556478 H3BNC9 293 aa22.95■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 ZNF862O60290 1169 aa22.95■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 RPS6KA5O75582 802 aa22.95■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 GATMP50440 423 aa22.95■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 AK2P54819 239 aa22.95■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 NPY5RQ15761 445 aa22.95■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.95■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.95■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.95■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.95■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 M0R2N6 131 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 MGEA5O60502 916 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 DGKIO75912 1065 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 CDKL5O76039 1030 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 PRKCEQ02156 737 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 PTPROQ16827 1216 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 NECAB1Q8N987 351 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 RIT2Q99578 217 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 AKT3Q9Y243 479 aa22.94■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 PFKFB2O60825 505 aa22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 OATP04181 439 aa22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 LETM2Q2VYF4 491 aa22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 Q4G0T1 1027 aa22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 FAM167AQ96KS9 214 aa22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 ARID2Q68CP9 1835 aa22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 MUC3AQ02505 3323 aa22.93■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 DENND3A2RUS2 1198 aa22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 BMPR1AP36894 532 aa22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 JAK3P52333 1124 aa22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 BANK1Q8NDB2 785 aa22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 ADAM2Q99965 735 aa22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.91■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 TMEM150BA6NC51 233 aa22.91■■□□□ 1.26
ATL1-209ENST00000556478 GRM6O15303 877 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms