RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.18■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 MSRAQ9UJ68 235 aa26.18■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 ZBBXA8MT70 800 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 CHMP2AO43633 222 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 NEMFO60524 1076 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 GUCY1B3Q02153 619 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 TIFAQ96CG3 184 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHA12Q9UN75 941 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 CDY2AQ9Y6F7 541 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 GRXCR1A8MXD5 290 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 WNT7AO00755 349 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 CTSHP09668 335 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 QARSP47897 775 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 KCNJ6P48051 423 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 HERC6Q8IVU3 1022 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 C4orf19Q8IY42 314 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 OSBPL7Q9BZF2 842 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 TRPV2Q9Y5S1 764 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 CHD9Q3L8U1 2897 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 TTC3P53804 2025 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 LPIN1Q14693 890 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 CALCRLQ16602 461 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 NEK9Q8TD19 979 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 M0QZ92 97 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 LYPLA2O95372 231 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 PBX2P40425 430 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 Q7L0L9 218 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF576Q9H609 170 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDSP2-203ENST00000547701 KIF28PB7ZC32 967 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 MARCH6O60337 910 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 GJB5O95377 273 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 TMOD1P28289 359 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 GJB2P29033 226 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 FOSBP53539 338 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 CDC42EP1Q00587 391 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 ZBTB10Q96DT7 871 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 GUCD1Q96NT3 240 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 ANO5Q75V66 913 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 EXOC8Q8IYI6 725 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 FTHL17Q9BXU8 183 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM60Q9H2L4 133 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 GPR32O75388 356 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 SLITRK3O94933 977 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 GHRP10912 638 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 DEFB103AP81534 67 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 BANK1Q8NDB2 785 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 TOP1MTQ969P6 601 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 COL4A6Q14031 1691 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 CHD7Q9P2D1 2997 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 MAFO75444 373 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 AMHP03971 560 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 TTC38Q5R3I4 469 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 ODR4Q5SWX8 454 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 EFCAB12Q6NXP0 572 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 RAD9AQ99638 391 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC28A3Q9HAS3 691 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 COL6A3P12111 3177 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 LAD1O00515 517 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 MCM7P33993 719 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 SNX21Q969T3 373 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 LXNQ9BS40 222 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 CYP26B1Q9NR63 512 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 TXKP42681 527 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 RABGGTBP53611 331 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 OTUD6AQ7L8S5 288 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 MAP7D2Q96T17 732 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 ADAMTS10Q9H324 1103 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-203ENST00000547701 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CTDSP2-203ENST00000547701 OR52Z1P0C646 297 aa26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms