RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 F8W031 263 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 MYO1BO43795 1136 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 COBLO75128 1261 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 B3GALT4O96024 378 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 ARNTP27540 789 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 ARSHQ5FYA8 562 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 TAF7LQ5H9L4 462 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 HERVK_113Q902F9 699 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 PRR19A6NJB7 356 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 DRD2P14416 443 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 SNX17Q15036 470 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 TKFCQ3LXA3 575 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 TRIM60Q495X7 471 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 C2orf27AQ580R0 203 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 CHMP5Q9NZZ3 219 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 RLFQ13129 1914 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 PRKAR2BP31323 418 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 RGS3P49796 1198 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 CASP7P55210 303 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 AMPD3Q01432 767 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 TNFAIP1Q13829 316 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 SPATC1Q76KD6 591 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 COPS6Q7L5N1 327 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 FEZ1Q99689 392 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 SPTBN2O15020 2390 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 ID4P47928 161 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 KRT40Q6A162 431 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 C16orf59Q7L2K0 433 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 SNX21Q969T3 373 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 COG5Q9UP83 839 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 TECTAO75443 2155 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 FRMPD3Q5JV73 1810 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 COL4A6Q14031 1691 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 BCAR3O75815 825 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 IGHDP01880 384 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 CTSBP07858 339 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 ALADP13716 330 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 CYP2B6P20813 491 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 MAOBP27338 520 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 AK9Q5TCS8 1911 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 A0A1W2PQH9 124 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 FSD2A1L4K1 749 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 DNM1LO00429 736 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-216ENST00000537568 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms