RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530483.1

TTC17-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 2

Gene TTC17, Length 456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-211ENST00000530483 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 LCORLQ8N3X6 602 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 SDR42E1Q8WUS8 393 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 COA7Q96BR5 231 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 C20orf173Q96LM9 149 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 CRBNQ96SW2 442 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 ACSS3Q9H6R3 686 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 C1GALT1Q9NS00 363 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 MORF4L1Q9UBU8 362 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 SWAP70Q9UH65 585 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GABRQQ9UN88 632 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 TTC41PQ6P2S7 1318 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 MYPNQ86TC9 1320 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 ANKRD33BA6NCL7 494 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 NPIPB6E9PJ23 425 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 ADCY3O60266 1144 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 CHGBP05060 677 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 CCL5P13501 91 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 CAPN2P17655 700 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GNAT2P19087 354 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GUCY1A2P33402 732 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 AFMP43652 599 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 CDK8P49336 464 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 HERVK_113P62684 666 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 SEPT2Q15019 361 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 KCNA10Q16322 511 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 SPRED3Q2MJR0 410 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 C12orf60Q5U649 245 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 CTR9Q6PD62 1173 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 MPZL3Q6UWV2 235 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 TMEM179Q6ZVK1 233 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 AMOTL1Q8IY63 956 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 ACER1Q8TDN7 264 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 APPBP2Q92624 585 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 OSBP2Q969R2 916 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GCC1Q96CN9 775 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 DYNLL2Q96FJ2 89 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 BORCS6Q96GS4 357 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 HRASLS5Q96KN8 279 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 C12orf42Q96LP6 360 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 CCDC17Q96LX7 622 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 TCF12Q99081 682 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 FEZ1Q99689 392 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 BCO2Q9BYV7 579 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 MKNK2Q9HBH9 465 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 HOXC10Q9NYD6 342 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GJD2Q9UKL4 321 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 U3KQE9 123 aa4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 A0A1W2PRG0 241 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 METTL12A8MUP2 240 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GSG1L2A8MUP6 293 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 CNMDO75829 334 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 SGPL1O95470 568 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 IGHA2P01877 340 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 APPP05067 770 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GJB1P08034 283 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GLI1P08151 1106 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 TMEM253P0C7T8 217 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 AKR1B1P15121 316 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 VCAM1P19320 739 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 MX1P20591 662 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GSTT1P30711 240 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 MAPK4P31152 587 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GRIA4P48058 902 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 GJA8P48165 433 aa3.99□□□□□ -1.77
TTC17-211ENST00000530483 ERVK-24P63145 666 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms