RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 SV2BQ7L1I2 683 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 DYMQ7RTS9 669 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 GPBP1Q86WP2 473 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 KBTBD4Q9NVX7 518 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB42B2RXF5 422 aa25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 PTMSP20962 102 aa25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 MUTP22033 750 aa25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 PSEN2P49810 448 aa25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 CUL4BQ13620 913 aa25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP26B1Q9NR63 512 aa25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 NRBP2Q9NSY0 501 aa25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.642e-11■■■■■ 51.5
TSNARE1-208ENST00000524325 INSRRP14616 1297 aa25.33■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 CST5P28325 142 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 ACLYP53396 1101 aa25.33■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 PADI6Q6TGC4 694 aa25.33■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.33■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 ZEB2O60315 1214 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP11B2P19099 503 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 HIC1Q14526 733 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 VTI1AQ96AJ9 217 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 TIGD1Q96MW7 591 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 SETD4Q9NVD3 440 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC26A2P50443 739 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX12PQ92771 950 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP89Q96ST8 783 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 CUEDC2Q9H467 287 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 USP25Q9UHP3 1055 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 HAS3O00219 553 aa25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 HBP1O60381 514 aa25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 SGPL1O95470 568 aa25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 POSTNQ15063 836 aa25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 NBPF20Q3BBV1 942 aa25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM167AQ96KS9 214 aa25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 TNMDQ9H2S6 317 aa25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 GPRC5CQ9NQ84 441 aa25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 GRIN2DO15399 1336 aa25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 SFI1A8K8P3 1242 aa25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 GJB1P08034 283 aa25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 RSPH10BP0C881 870 aa25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 PPFIA1Q13136 1202 aa25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM9Q9C026 710 aa25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 KPNA6O60684 536 aa25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 GRIK4Q16099 956 aa25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 ISM2Q6H9L7 571 aa25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PQY0 241 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 KBTBD13C9JR72 458 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 DRP2Q13474 957 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC71Q8N4P6 559 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 REEP2Q9BRK0 252 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 ASIC1P78348 528 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 DPYDQ12882 1025 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 C7orf31Q8N865 590 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 HPS3Q969F9 1004 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM143Q96AN5 459 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC19Q96DA6 116 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-208ENST00000524325 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.27■■□□□ 1.64
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