RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM196BA6NMK8 535 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIDE1A8MVS5 230 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNAP23O00161 211 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 FSCN2O14926 492 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAD21O60216 631 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBC1D12O60347 775 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 OPHN1O60890 802 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPFIA2O75334 1257 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKAP3O75969 853 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALX3O95076 343 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A27O95847 323 aa2.41□□□□□ -2.02
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RNU6-548P-201ENST00000517083 CAP2P40123 477 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CASRP41180 1078 aa2.41□□□□□ -2.02
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RNU6-548P-201ENST00000517083 UQCRFS1P47985 274 aa2.41□□□□□ -2.02
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RNU6-548P-201ENST00000517083 HTR4Q13639 388 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MBTPS1Q14703 1052 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTGISQ16647 500 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAPK6Q16659 721 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM61Q5EBN2 209 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 C6orf118Q5T5N4 469 aa2.41□□□□□ -2.02
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RNU6-548P-201ENST00000517083 XKR5Q6UX68 686 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q71RC1 249 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYP2U1Q7Z449 544 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERICH1Q86X53 443 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPEM1Q8N4L4 309 aa2.41□□□□□ -2.02
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM87AQ8NBN3 555 aa2.41□□□□□ -2.02
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RNU6-548P-201ENST00000517083 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa2.41□□□□□ -2.02
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNNM1Q9NRU3 951 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 DZANK1Q9NVP4 752 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR3EQ9NVU0 708 aa2.41□□□□□ -2.02
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TANC1Q9C0D5 1861 aa2.41□□□□□ -2.02
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RNU6-548P-201ENST00000517083 NLRC5Q86WI3 1866 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
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RNU6-548P-201ENST00000517083 K7ENP7 123 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 F12P00748 615 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYL3P08590 195 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 HOXA6P31267 233 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRKAR2BP31323 418 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 COPB2P35606 906 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTN2P35609 894 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLRC3Q07444 240 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 NEUROD1Q13562 356 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 GAS6Q14393 721 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 COG2Q14746 738 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDIA6Q15084 440 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00303Q3SY05 128 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 DUSP28Q4G0W2 176 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM198Q66K66 360 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFRKBQ6P4R8 1299 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 BHLHB9Q6PI77 547 aa2.4□□□□□ -2.03
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