RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509593.1

ABCE1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 5

Gene ABCE1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-208	ENST00000509593	ADCY8	P40145	1251 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	GDF5	P43026	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	RAC3	P60763	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	IL13RA1	P78552	427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SEC23A	Q15436	765 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	FZD7	O75084	574 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CR2	P20023	1033 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	GJA4	P35212	333 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	KCNQ1	P51787	676 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	GABRE	P78334	506 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	TBR1	Q16650	682 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SCLY	Q96I15	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	MATN2	O00339	956 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	GSTA4	O15217	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	MPIG6B	O95866	241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	AOAH	P28039	575 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	ETV4	P43268	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593		Q6ZSN1	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	SCD	O00767	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	PLSCR1	O15162	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	CDC14B	O60729	498 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	RASGRP1	O95267	797 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	HMGCR	P04035	888 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	MME	P08473	750 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	NAT1	P18440	290 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	COMT	P21964	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	MASP1	P48740	699 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	HMGA2	P52926	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	HERVK_113	P62684	666 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	CD83	Q01151	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	STIL	Q15468	1287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	EXTL1	Q92935	676 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593		A0A087X0B3	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	CYR61	O00622	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	SUV39H1	O43463	412 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	RAD17	O75943	681 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	KCNA6	P17658	529 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	ECE1	P42892	770 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	KLF10	Q13118	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-208	ENST00000509593	FOXE3	Q13461	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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