RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 PPP2CAP67775 309 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 KANK2Q63ZY3 851 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 NIM1KQ8IY84 436 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 WDR48Q8TAF3 677 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 NINJ1Q92982 152 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 FAM83GA6ND36 823 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 HMGCRP04035 888 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ETV4P43268 484 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 NEK4P51957 841 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 EPHB4P54760 987 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 EFEMP1Q12805 493 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 LOXL4Q96JB6 756 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 FEZ1Q99689 392 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 FNTBP49356 437 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF174Q15697 407 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 FBXO10Q9UK96 956 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 GPR42O15529 346 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 SLC9A1P19634 815 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 MOGSQ13724 837 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF827Q17R98 1081 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 SLFN13Q68D06 897 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 NXPE1Q8N323 547 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 CALML6Q8TD86 181 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ACSS2Q9NR19 701 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 TBX22Q9Y458 520 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 A0A0G2JNJ9 132 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 PRLP01236 227 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 RGS3P49796 1198 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 STAT5BP51692 787 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP10-2P60368 255 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 SLC6A3Q01959 620 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 SPATS1Q496A3 300 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 MFSD3Q96ES6 412 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 FOXB1Q99853 325 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 Q9UFV3 132 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 PLAAQ9Y263 795 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ENPP3O14638 875 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 GAS7O60861 476 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 NFKB2Q00653 900 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 RNF151Q2KHN1 245 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 C8orf49Q96NF6 230 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 GNRHR2Q96P88 292 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 MTFR1LQ9H019 292 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 OXSMQ9NWU1 459 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 CYP17A1P05093 508 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 DSG1Q02413 1049 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-215ENST00000506510 PCOLCEQ15113 449 aa6.72□□□□□ -1.33
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