RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.861e-10■■□□□ 12.9
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PKP4-216ENST00000495123 MBTPS1Q14703 1052 aa9.71□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 SHHQ15465 462 aa9.71□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.71□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.71□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.71□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 COL1A2P08123 1366 aa9.71□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 MED24O75448 989 aa9.7□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 C22orf31O95567 290 aa9.7□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 XKR3Q5GH77 459 aa9.7□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 TMEM240Q5SV17 173 aa9.7□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 TDHQ8IZJ6 230 aa9.7□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.7□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.863e-11■□□□□ 10.1
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PKP4-216ENST00000495123 PRPHP41219 470 aa9.69□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 TCTN1Q2MV58 587 aa9.69□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 WDR81Q562E7 1941 aa9.69□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 TPH2Q8IWU9 490 aa9.69□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.69□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.69□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 NEK9Q8TD19 979 aa9.69□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.69□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 CDY2AQ9Y6F7 541 aa9.69□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 F13A1P00488 732 aa9.68□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 CDC25AP30304 524 aa9.68□□□□□ -0.86
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PKP4-216ENST00000495123 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 FAM26DQ5JW98 314 aa9.68□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.68□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.68□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.68□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.68□□□□□ -0.86
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