RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492861.1

PKDCC-209, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, human

TSL 2

Gene PKDCC, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKDCC-209	ENST00000492861	NKX3-2	P78367	333 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	EHHADH	Q08426	723 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	DDX12P	Q92771	950 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	STAM	Q92783	540 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	SORBS3	O60504	671 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	SGPL1	O95470	568 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	OAT	P04181	439 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	INHA	P05111	366 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ELN	P15502	786 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	CASP1	P29466	404 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	STAT5B	P51692	787 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ANO5	Q75V66	913 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	AZI2	Q9H6S1	392 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ZBTB39	O15060	712 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	SEPT4	O43236	478 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	LGALS2	P05162	132 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	MMP3	P08254	477 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	CAPN2	P17655	700 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ATP4A	P20648	1035 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ZNF131	P52739	623 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	MLKL	Q8NB16	471 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	GAP43	P17677	238 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	BMP6	P22004	513 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	CPT1A	P50416	773 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	PSMD2	Q13200	908 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	GIT2	Q14161	759 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	DGKD	Q16760	1214 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	XKR9	Q5GH70	373 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	REEP2	Q9BRK0	252 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	DACH1	Q9UI36	760 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861		A0A087WWV3	80 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	BIN1	O00499	593 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	DGAT1	O75907	488 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	PTGS1	P23219	599 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	PPP1R2	P41236	205 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	GJA9	P57773	515 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	COASY	Q13057	564 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	MAPK7	Q13164	816 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	GLG1	Q92896	1179 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-209	ENST00000492861	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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