RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 INCENPQ9NQS7 918 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 DLL4Q9NR61 685 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 GABRDO14764 452 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 FBXO21O94952 628 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 MPIG6BO95866 241 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 KRT1P04264 644 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 EPHB3P54753 998 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ROM1Q03395 351 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 CALML6Q8TD86 181 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 MAML3Q96JK9 1138 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ACAP3Q96P50 834 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 GALNT8Q9NY28 637 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 WASF3Q9UPY6 502 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 LCHNA4D1U4 455 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 PRLP01236 227 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 C1QTNF9P0C862 333 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 THBS2P35442 1172 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 EPHB1P54762 984 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ITGA1P56199 1179 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 FOXO4P98177 505 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 SLC6A3Q01959 620 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 PDCD1Q15116 288 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 INAVAQ3KP66 663 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 JDP2Q8WYK2 163 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 WRNIP1Q96S55 665 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 POFUT1Q9H488 388 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ECE1P42892 770 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 NEK2P51955 445 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 SCAND1P57086 179 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 MOGSQ13724 837 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ZNF124Q15973 351 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 TTLL6Q8N841 843 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 WDR48Q8TAF3 677 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 CLIC6Q96NY7 704 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 MYL10Q9BUA6 226 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 BTBD2Q9BX70 525 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 AMNQ9BXJ7 453 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 CD320Q9NPF0 282 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 SHTN1A0MZ66 631 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 CFBP00751 764 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 MYBL2P10244 700 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ADAM9Q13443 819 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 KCNA10Q16322 511 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 CMIPQ8IY22 773 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 KYQ8NBH2 561 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 FERMT2Q96AC1 680 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 SYT3Q9BQG1 590 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 TRIM75PA6NK02 468 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 CYP7B1O75881 506 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 APOL3O95236 402 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ENPP1P22413 925 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 GPR3P46089 330 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 LIMS1P48059 325 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 GLRBP48167 497 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 RGS3P49796 1198 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ADCY2Q08462 1091 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 MYBPC3Q14896 1274 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 PTPN21Q16825 1174 aa6.66□□□□□ -1.34
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