RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 C7orf61Q8IZ16 206 aa5.9□□□□□ -1.46
CNN3-206ENST00000487539 TCTN2Q96GX1 697 aa5.9□□□□□ -1.46
CNN3-206ENST00000487539 SHDQ96IW2 340 aa5.9□□□□□ -1.46
CNN3-206ENST00000487539 SNX27Q96L92 541 aa5.9□□□□□ -1.46
CNN3-206ENST00000487539 SORCS2Q96PQ0 1159 aa5.9□□□□□ -1.46
CNN3-206ENST00000487539 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CNN3-206ENST00000487539 MENTQ9BUN1 341 aa5.9□□□□□ -1.46
CNN3-206ENST00000487539 CHST7Q9NS84 486 aa5.9□□□□□ -1.46
CNN3-206ENST00000487539 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CNN3-206ENST00000487539 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
CNN3-206ENST00000487539 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 C9IYK1 514 aa5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 PRKG1Q13976 671 aa5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 TNIP1Q15025 636 aa5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 OXR1Q8N573 874 aa5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 SP110Q9HB58 689 aa5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 USP16Q9Y5T5 823 aa5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 KIF20BQ96Q89 1820 aa5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ZNF609O15014 1411 aa5.89□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 HMGA2P52926 109 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 CASP7P55210 303 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 TEKQ02763 1124 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 KIAA2012Q0VF49 1180 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 CRHR2Q13324 411 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 PPP2R5EQ16537 467 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 SP8Q8IXZ3 490 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 DPF2Q92785 391 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 DSCC1Q9BVC3 393 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 DBNDD1Q9H9R9 158 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 TCFL5Q9UL49 500 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 PALD1Q9ULE6 856 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 IRAK3Q9Y616 596 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 CDHR2Q9BYE9 1310 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 RTL9Q8NET4 1388 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 KDM3BQ7LBC6 1761 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 UBR2Q8IWV8 1755 aa5.88□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 CACNA1AO00555 2505 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 A0A1W2PPC1 479 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 A0A1W2PQH9 124 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 FITM1A5D6W6 292 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 GSNP06396 782 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ZGLP1P0C6A0 271 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 SLC7A5Q01650 507 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 CHRNEQ04844 493 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 MAP3K12Q12852 859 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 TCEAL1Q15170 157 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 GNPTABQ3T906 1256 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 SULT6B1Q6IMI4 303 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 PPFIBP1Q86W92 1011 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 LILRA2Q8N149 483 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ERO1AQ96HE7 468 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 PTPN18Q99952 460 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 GDF15Q99988 308 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 RPTORQ8N122 1335 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 HEG1Q9ULI3 1381 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ALPK3Q96L96 1907 aa5.87□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 TAF1P21675 1872 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 SYPP08247 313 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ITGA4P13612 1032 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 BMP8BP34820 402 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 FKBP1BP68106 108 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 SP3Q02447 781 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ARID5AQ03989 594 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 SREBF2Q12772 1141 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 RTP5Q14D33 572 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 TNNI3KQ59H18 835 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 DCAF15Q66K64 600 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 CLEC4GQ6UXB4 293 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 CLMNQ96JQ2 1002 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 TINF2Q9BSI4 451 aa5.86□□□□□ -1.47
CNN3-206ENST00000487539 FOXP3Q9BZS1 431 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms