RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487036.1

FAM208A-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member A, human

TSL 3

Gene FAM208A, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208A-208	ENST00000487036	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	CEP72	Q9P209	647 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC27A2	O14975	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	FAH	P16930	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	SDS	P20132	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	ECI1	P42126	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	IL12RB1	P42701	662 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	KCNJ6	P48051	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	PFKP	Q01813	784 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	SCLY	Q96I15	445 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036		H0Y858	1186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	FBXO21	O94952	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	CP	P00450	1065 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	ADH4	P08319	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	GABRE	P78334	506 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	AMPD3	Q01432	767 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	FOXL1	Q12952	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	CFHR4	Q92496	578 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	LTF	P02788	710 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	MAK	P20794	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	POLD1	P28340	1107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	STAT3	P40763	770 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	NFYC	Q13952	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	TBR1	Q16650	682 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	RNF180	Q86T96	592 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	PRRX2	Q99811	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	KRIT1	O00522	736 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	PDE8A	O60658	829 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	MAFK	O60675	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	MSC	O60682	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	RASGRP1	O95267	797 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	GJA4	P35212	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF460	Q14592	562 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms