RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-206ENST00000479153 PPFIA1Q13136 1202 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 HIC1Q14526 733 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 XKR9Q5GH70 373 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 CEP170P1Q96L14 293 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 MYH11P35749 1972 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 MUTP22033 750 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 UBE2HP62256 183 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 MCM6Q14566 821 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 GRIK4Q16099 956 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 HPSEQ9Y251 543 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 COL6A1P12109 1028 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 LIG1P18858 919 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 SYKP43405 635 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 RARRES1P49788 294 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 STAMQ92783 540 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 ALPK3Q96L96 1907 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 ARVCFO00192 962 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 SLC26A4O43511 780 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 EYA4O95677 639 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 PLA2G4BP0C869 781 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 MCM4P33991 863 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 E2F4Q16254 413 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 RAD54LQ92698 747 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 POLD4Q9HCU8 107 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 NRCAMQ92823 1304 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 TREHO43280 583 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 NR1I2O75469 434 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 LONRF3Q496Y0 759 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 IQUBQ8NA54 791 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 CEP89Q96ST8 783 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 ZNF202O95125 648 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 KLRC1P26715 233 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 SLC12A3P55017 1021 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 STK17AQ9UEE5 414 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 COL1A2P08123 1366 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 B4GALT4O60513 344 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 C22orf31O95567 290 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 CAPN2P17655 700 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 CDK7P50613 346 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 ADAM17P78536 824 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 PTGISQ16647 500 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 TRIM60Q495X7 471 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 PADI6Q6TGC4 694 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 SESTD1Q86VW0 696 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 METTL13Q8N6R0 699 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMO3-206ENST00000479153 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms