RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 RARRES1P49788 294 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 NPEPPSP55786 919 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 CALML4Q96GE6 196 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 PLIN2Q99541 437 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 HPSEQ9Y251 543 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 B4GALT4O60513 344 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 C22orf31O95567 290 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 CD4P01730 458 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 TXLNAP40222 546 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 E2F4Q16254 413 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 TRIM60Q495X7 471 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 ALPK3Q96L96 1907 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 E9PMD0 336 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 EYA4O95677 639 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 PFKFB1P16118 471 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 RTP1P59025 263 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 MTERF2Q49AM1 385 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 TOX2Q96NM4 488 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 DNM3Q9UQ16 869 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 PPME1Q9Y570 386 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 TREHO43280 583 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 IGBP1P78318 339 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 XKR9Q5GH70 373 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 SERINC5Q86VE9 423 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 CEP170P1Q96L14 293 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 GBP4Q96PP9 640 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 STK17AQ9UEE5 414 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 A0A1B0GVL5 298 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 GNAT1P11488 350 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 SLC12A3P55017 1021 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 TLE2Q04725 743 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 PTGISQ16647 500 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 FSIP1Q8NA03 581 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 RAD54LQ92698 747 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 KAT6AQ92794 2004 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 KLRC1P26715 233 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 NDUFA8P51970 172 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 PDILTQ8N807 584 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 WNT8BQ93098 351 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 PANK2Q9BZ23 570 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 PLA2G4BP0C869 781 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 RFC5P40937 340 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 FAAP100Q0VG06 881 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 MAGEB2O15479 319 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 STAT6P42226 847 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 PTK7Q13308 1070 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 MCM6Q14566 821 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 EMC2Q15006 297 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 PADI6Q6TGC4 694 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-210ENST00000477812 TBX21Q9UL17 535 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms