RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	RDM1	Q8NG50	284 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TIFA	Q96CG3	184 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP89	Q96ST8	783 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC9A7	Q96T83	725 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	VTN	P04004	478 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCM7	P33993	719 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP4A11	Q02928	519 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	DRP2	Q13474	957 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CALCRL	Q16602	461 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTERF2	Q49AM1	385 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM20A	Q96MK3	541 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTMR9	Q96QG7	549 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	LXN	Q9BS40	222 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	RGL1	Q9NZL6	768 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC3	P53804	2025 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CA3	P07451	260 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41	3e-10	■■□□□ 13.9
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD52	P31358	61 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNJ6	P48051	423 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CUL4A	Q13619	759 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	GRIN2C	Q14957	1233 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF174	Q15697	407 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC38	Q5R3I4	469 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANO5	Q75V66	913 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYLIP	Q8WY64	445 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	DYDC2	Q96IM9	177 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM167A	Q96KS9	214 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	EPOP	A6NHQ4	379 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB39	O15060	712 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TXK	P42681	527 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCM2	P49736	904 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPEPPS	P55786	919 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSMC5	P62195	406 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB30	Q15771	203 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	RSPH3	Q86UC2	560 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	METTL13	Q8N6R0	699 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEPT8	Q92599	483 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	OSMR	Q99650	979 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF576	Q9H609	170 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	GINS2	Q9Y248	185 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYO9B	Q13459	2157 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MGEA5	O60502	916 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR32	O75388	356 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR52Z1	P0C646	297 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	IKBKE	Q14164	716 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	EPHA7	Q15375	998 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	XKR3	Q5GH77	459 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMX1	Q9H3N1	280 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MSRA	Q9UJ68	235 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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