RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.63■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 ZNF263O14978 683 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 JAK3P52333 1124 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 TUBB4BP68371 445 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 KCNA1Q09470 495 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 KIF5AQ12840 1032 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 MAPK7Q13164 816 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 PADI6Q6TGC4 694 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 STRA6Q9BX79 667 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 GANQ9H2C0 597 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 DEF6Q9H4E7 631 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 RIPK3Q9Y572 518 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 MYH11P35749 1972 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 MAFGO15525 162 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 PPP1R37O75864 691 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 SFNP31947 248 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 AMPD2Q01433 879 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 KRT76Q01546 638 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 ODR4Q5SWX8 454 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 HGSNATQ68CP4 663 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 RDM1Q8NG50 284 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 GOLGA1Q92805 767 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 TIPINQ9BVW5 301 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 POLD4Q9HCU8 107 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 RCCD1A6NED2 376 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 AKR1B10O60218 316 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 HIP1RO75146 1068 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 SERPING1P05155 500 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 CCND2P30279 289 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 RARRES1P49788 294 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 ALCAMQ13740 583 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 C4orf19Q8IY42 314 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 DAW1Q8N136 415 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.892e-21■□□□□ 10.2
NME4-210ENST00000468031 GPRASP2Q96D09 838 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 BORCS6Q96GS4 357 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 WDR64B1ANS9 1081 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 CYP27A1Q02318 531 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 RABGGTAQ92696 567 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 SLC35C1Q96A29 364 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 GBP3Q9H0R5 595 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 SAMM50Q9Y512 469 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 CASP4P49662 377 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 MYBPC2Q14324 1141 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 DMAC2Q9NW81 257 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 MYO6Q9UM54 1294 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 FZD1Q9UP38 647 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 ANO9A1A5B4 782 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 CLIC2O15247 247 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 PJA2O43164 708 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 CHMP4BP1P59074 171 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 NLRX1Q86UT6 975 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-210ENST00000468031 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms