RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.05■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.05■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 TPH2Q8IWU9 490 aa23.05■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 ZNF862O60290 1169 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 TECP42680 631 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 PDIA5Q14554 519 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 WNT8BQ93098 351 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 LXNQ9BS40 222 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 MSRAQ9UJ68 235 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 LTBP2Q14767 1821 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 NBNO60934 754 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 PRPHP41219 470 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 PTGDRQ13258 359 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 MTERF2Q49AM1 385 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 RASIP1Q5U651 963 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 CEP170P1Q96L14 293 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 SLC9A7Q96T83 725 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 C22orf31O95567 290 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 SYT1P21579 422 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 MUTP22033 750 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 RFC5P40937 340 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 RAB30Q15771 203 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 UGCGQ16739 394 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 DYDC2Q96IM9 177 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 AKT3Q9Y243 479 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-209ENST00000462357 SLITRK3O94933 977 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 LYPLA2O95372 231 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 CHRNA1P02708 482 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 CYP4A11Q02928 519 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
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IMP4-209ENST00000462357 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.01■■□□□ 1.27
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IMP4-209ENST00000462357 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.01■■□□□ 1.27
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IMP4-209ENST00000462357 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.01■■□□□ 1.27
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IMP4-209ENST00000462357 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB42B2RXF5 422 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 AMHP03971 560 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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IMP4-209ENST00000462357 NACC1Q96RE7 527 aa23■■□□□ 1.27
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IMP4-209ENST00000462357 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 GHRP10912 638 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 RPA1P27694 616 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 PAK2Q13177 524 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
IMP4-209ENST00000462357 POTEMA6NI47 508 aa22.97■■□□□ 1.27
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