RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PLCG1P19174 1290 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 HOXC8P31273 242 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 YWHABP31946 246 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 TXLNAP40222 546 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SOX10P56693 466 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CHMP4BP1P59074 171 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ITGA7Q13683 1181 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 HIC1Q14526 733 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 E2F4Q16254 413 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SESTD1Q86VW0 696 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CALML4Q96GE6 196 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 NACC1Q96RE7 527 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CEP89Q96ST8 783 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PLIN2Q99541 437 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 C11orf49Q9H6J7 331 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 TRPC6Q9Y210 931 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 HPSEQ9Y251 543 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1B0GVL5 298 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 E9PMD0 336 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 INSRRP14616 1297 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PFKFB1P16118 471 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 RARRES1P49788 294 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CDK7P50613 346 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 NPEPPSP55786 919 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PPFIA1Q13136 1202 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SNX17Q15036 470 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 MARCH8Q5T0T0 291 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 C7orf31Q8N865 590 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 FSIP1Q8NA03 581 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 NRBP2Q9NSY0 501 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CCDC39Q9UFE4 941 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 NRCAMQ92823 1304 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ARVCFO00192 962 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 EYA4O95677 639 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 NDUFA8P51970 172 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ADAM17P78536 824 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 GRIK4Q16099 956 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 MTERF2Q49AM1 385 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF484Q5JVG2 852 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 RRAGBQ5VZM2 374 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 OTUD6AQ7L8S5 288 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PDILTQ8N807 584 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 RASSF8Q8NHQ8 419 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 RAD54LQ92698 747 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 VTI1AQ96AJ9 217 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CTAGE1Q96RT6 745 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SH2D3AQ9BRG2 576 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PANK2Q9BZ23 570 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CYP26B1Q9NR63 512 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SETD4Q9NVD3 440 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 STK17AQ9UEE5 414 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 KCNH3Q9ULD8 1083 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 DNM3Q9UQ16 869 aa11.43□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SIP14410 1827 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 EVPLQ92817 2033 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms