RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 GJA10Q969M2 543 aa27.13■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 UNC45AQ9H3U1 944 aa27.13■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 PADI3Q9ULW8 664 aa27.13■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 DTNBO60941 627 aa27.12■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 SFNP31947 248 aa27.12■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 ME3Q16798 604 aa27.12■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM167AQ96KS9 214 aa27.12■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 SAMD11Q96NU1 681 aa27.12■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 ASB2Q96Q27 587 aa27.12■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 FTHL17Q9BXU8 183 aa27.12■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 CEP131Q9UPN4 1083 aa27.12■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF862O60290 1169 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 JAK3P52333 1124 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 INF2Q27J81 1249 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 B3GNT9Q6UX72 402 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 NECAB1Q8N987 351 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 FBXO22Q8NEZ5 403 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 LINC01599Q8WXQ3 324 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 CDHR5Q9HBB8 845 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 NRBP2Q9NSY0 501 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 GJB4Q9NTQ9 266 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 CHMP2AO43633 222 aa27.1■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 FDPSP14324 419 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 NEK4P51957 841 aa27.1■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 PAK2Q13177 524 aa27.1■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 EPC2Q52LR7 807 aa27.1■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 RDM1Q8NG50 284 aa27.1■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 ETNPPLQ8TBG4 499 aa27.1■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 WASF1Q92558 559 aa27.1■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa27.09■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 MAGEB2O15479 319 aa27.09■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 LARGE1O95461 756 aa27.09■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM192Q8IY95 271 aa27.09■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 CRIPAKQ8N1N5 446 aa27.09■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 GTF3C6Q969F1 213 aa27.09■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 COL4A6Q14031 1691 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 OATP04181 439 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 UGCGQ16739 394 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 LETM2Q2VYF4 491 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 MIER3Q7Z3K6 550 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 FIBCD1Q8N539 461 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 METTL13Q8N6R0 699 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 OXER1Q8TDS5 423 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 TMX1Q9H3N1 280 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 GINS2Q9Y248 185 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 REV3LO60673 3130 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CB-208ENST00000455580 DGKIO75912 1065 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 PRKCEQ02156 737 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM266Q2M3C6 531 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 NEK8Q86SG6 692 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 LINC01465Q8N7H1 131 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM40Q8WWA1 233 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 ERVK-5Q9HDB9 667 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 TTC3P53804 2025 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 H3BNC9 293 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC37A4O43826 429 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 GPR32O75388 356 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 RPS6KA5O75582 802 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 PPP4R3AQ6IN85 833 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 EFCAB12Q6NXP0 572 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 COG5Q9UP83 839 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 CUL9Q8IWT3 2517 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 EVPLQ92817 2033 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 VTNP04004 478 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 KIZQ2M2Z5 673 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 ODR4Q5SWX8 454 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 STBD1O95210 358 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 LINC00271P0C7V0 271 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 TMOD1P28289 359 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 CLCN3P51790 818 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 TFF2Q03403 129 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 GPM6BQ13491 265 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 NPAS4Q8IUM7 802 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM20AQ96MK3 541 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 OSMRQ99650 979 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 KCNMB3Q9NPA1 279 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CB-208ENST00000455580 GPR182O15218 404 aa27.03■■□□□ 1.92
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