RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF667Q5HYK9 610 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 FAM213AQ9BRX8 229 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 ATP8B3O60423 1300 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 ZBTB7AO95365 584 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 RPSAP08865 295 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 STAT3P40763 770 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 RASGRF2O14827 1237 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 MFAP3LO75121 409 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 SNCBQ16143 134 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 PADI6Q6TGC4 694 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 Q9H521 79 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 SH3GLB2Q9NR46 395 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 POTEB3A0JP26 581 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 POTECB2RU33 542 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 CLDN3O15551 220 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 POTEBQ6S5H4 581 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 SMIM5Q71RC9 77 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 MAP2K2P36507 400 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 PRELPP51888 382 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 STXBP2Q15833 593 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 PANX2Q96RD6 677 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 CFLARO15519 480 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 PALMO75781 387 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 PMLP29590 882 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 RWDD2BP57060 319 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 SLFN12LQ6IEE8 588 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 PYROXD1Q8WU10 500 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 FMO2Q99518 471 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 UNC13DQ70J99 1090 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 RMDN2Q96LZ7 410 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 ANAPC7Q9UJX3 599 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 PRR29P0C7W0 189 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 FAF2Q96CS3 445 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-209ENST00000438120 AP3B2Q13367 1082 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 SURF1Q15526 300 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 GANCQ8TET4 914 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 ZMYND12Q9H0C1 365 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 PP2D1A8MPX8 630 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 JAK3P52333 1124 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 E2F5Q15329 346 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 RNF217Q8TC41 542 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 INTUQ9ULD6 942 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 ARHGEF5Q12774 1597 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 CDC27P30260 824 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 ABCD1P33897 745 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 TTC30BQ8N4P2 665 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 NEK9Q8TD19 979 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 MAML1Q92585 1016 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 ABCB6Q9NP58 842 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 LMCD1Q9NZU5 365 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 ADAM22Q9P0K1 906 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 NR3C1P04150 777 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 ARL13BQ3SXY8 428 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM270Q6UE05 265 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 KDM6BO15054 1643 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 GOLGA8MH3BSY2 632 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 HAUS8Q9BT25 410 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 NARFQ9UHQ1 456 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 COL15A1P39059 1388 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 WDR64B1ANS9 1081 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 GSTA4O15217 222 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 PRCPP42785 496 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 POTEFA5A3E0 1075 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 POTEIP0CG38 1075 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 POTEGQ6S5H5 508 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 POTEEQ6S8J3 1075 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 RAD54LQ92698 747 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 PNMA3Q9UL41 463 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 MBD5Q9P267 1494 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 KDM5CP41229 1560 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 ALCAMQ13740 583 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF568Q3ZCX4 644 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF449Q6P9G9 518 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-209ENST00000438120 TSPOAP1O95153 1857 aa18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms